Efekty uboczne zażywania champix to: nudności, bóle głowy, zaburzenia snu, koszmary senne, zmęczenie, zaburzenia smaku, zwiększenie apetytu, i suchość w ustach. Nie jest jeszcze jasne, czy są to skutki uboczne zażywania champix czy może objawy abstynencyjne, lecz u niewielkiej grupy pacjentów mogą one wystąpić.
Zalecane jest trzymać się zaleceń lekarza dotyczących dawkowania w celu uniknięcia działań niepożądanych. Leku tego nie powinny przyjmować kobiety w ciąży oraz matki karmiące piersią. Należy unikać przedawkowania leku, oraz ograniczyć spożycie alkoholu podczas kuracji.